多见于3~10岁儿童，好发于夏秋季，同一患者可多次发生由不同型别病毒引起，潜伏期3~10天，多以突发高热开始，24~48h可达高峰，升至39~41℃,伴头痛，咽部不适，肌痛等，婴幼儿常有呕吐，拒食，甚而发生高热惊厥；年长儿童及成人常见严重的咽痛，吞咽困难，四肢肌痛，厌食乏力等，持续4~5天后，咽部出现灰色小丘疹，24h内发展为水疱和溃疡，其周围绕以1~5mm的红晕为特征性的病变，皮损常现于扁桃体前柱，软腭区缘和腭垂，经1~5天溃疡愈合，一般3天内退热，症状消失，本病预后良好。
急性淋巴性咽峡炎是由柯萨奇病毒a10型引起的一种变异的疱疹性咽峡炎，有如典型咽峡炎同样的损害，但不进展到水疱和溃疡，仅存留有淋巴细胞浸润所形成的灰白色丘疹，周围绕以红晕。
该病有流行趋势，常见于婴幼儿，临床特征为骤起高热伴有咽喉痛，头痛，厌食，并常有颈，腹和四肢疼痛，在婴儿常发生呕吐和惊厥，起病2日内口腔粘膜出现少数(很少多于12个)小的(直径1~2mm)灰白色疱疹，周围绕以红晕，多见于扁桃体前部，但也可位于软腭，扁桃体，悬雍垂，舌部等，在以后的24小时内水泡破溃变为浅溃疡，直径一般在5mm以下，1-5日内愈合，并发症少见：症状一般7日内消失，在感染后能产生持久的免疫，但a组中其他型病毒或其他肠道病毒也可能引起再次发病。
此病如单独发生，常无全身症状，患儿表现为起病急，突发高热，早期伴有流鼻涕，继而大一些的孩子会自诉口腔疼痛或拒食，小一些的宝宝则表现为烦躁，哭闹，流口水，尿色黄，短少，大便干燥成球，检查时，可见患儿上腭，口腔黏膜，咽后壁，扁桃体等口腔黏膜出现灰白色小疱疹，大约在1-2天内疱疹破溃形成溃疡，一般疱疹性咽峡炎往往都伴有牙龈一碰就出血，口腔内有臭味，还会伴有颌下淋巴结肿大，但很少波及口腔外部的皮肤。