淋球菌感染引起的临床表现取决于感染的程度，机体的敏感性，细菌的毒力，感染部位及感染时间的长短，同时和身体的健康状况，性生活是否过度，酗酒等有关。
1.原发性感染 指无并发症的泌尿生殖道淋病。
(1)男性淋病：
①急性淋病：潜伏期为1~14天，常为2~5天，表现为急性尿道炎症状，尿道口红肿，发痒及轻微刺痛，继而有稀薄黏液流出，引起排尿不适，约2天后，分泌物变得黏稠，尿道口溢脓，脓液呈深黄色或黄绿色，红肿发展到整个阴茎龟头及部分尿道，出现尿频，尿急，尿痛，排尿困难，行动不便，夜间阴茎常有痛性勃起，可有腹股沟淋巴结肿大，红肿疼痛，亦可化脓，有50%~70%的患者伴有淋球菌侵犯后尿道，表现为尿意窘迫，尿频，急性尿潴留，全身症状一般较轻，少数可有发热达38℃左右，全身不适，食欲缺乏等。
②慢性淋病：症状持续2个月以上，因为治疗不彻底，淋球菌可隐伏于尿道体，尿道旁腺，尿道隐窝使病程转为慢性，如患者体质虚弱，患贫血，结核病时，病情一开始就呈慢性经过，多为前，后尿道合并感染，好侵犯尿道球部，膜部及前列腺部，表现为尿道常有痒感，排尿时有灼热感或轻度刺痛，尿流细，排尿无力，滴尿，多数患者于清晨尿道有少量浆液痂封口，若挤压阴部或阴茎根部常见稀薄黏液溢出，尿液基本清晰，可见到淋丝。
(2)女性淋病：女性原发性淋球菌感染主要部位为子宫颈，部分患者无自觉症状，表现为白带增多，为脓性或不具有特性，常有外阴刺痒和烧灼感，伴宫颈充血，触痛，偶有下腹痛及腰痛，尿道口充血，有触痛及脓性分泌物，有轻度尿频，尿急，尿痛，排尿时有烧灼感；淋菌性阴道炎较少见，症状轻微，有些患者有腹部坠胀，腰背酸痛，白带较多，有些患者有下腹痛和月经过多等。
2.继发性感染
(1)男性淋病合并症：
①前列腺炎：急性前列腺炎有发热，寒战，会阴疼痛及伴有排尿困难等尿路感染症状，检查时前列腺肿胀，压痛，前列腺按摩液涂片或培养找到淋球菌，慢性前列腺炎症状轻微，多仅在早晨尿道口有分泌物。
②附睾炎和精囊炎：单侧居多，有附睾肿大疼痛，睾丸触痛，肿大，精囊炎时有发热，尿频，尿急，尿痛，终末尿混浊并带血，直肠检查可触及肿大的精囊，同时有剧烈的触痛，慢性精囊炎一般无自觉症状，直肠镜检查出精囊发硬，有纤维化。
③尿道球腺炎：发生在会阴或其左右，出现指头大小结节，疼痛，压迫尿道而排尿困难，急性可化脓破溃，可有发热等全身症状。
④尿道狭窄：反复发作者可引起尿道狭窄，少数可发生输精管狭窄或梗阻，出现排尿困难，严重时尿潴留，可继发输精管狭窄，精囊囊肿与不育。
(2)女性淋病合并症：女性淋病的主要合并症有淋菌性盆腔炎，如急性输卵管炎，子宫内膜炎，继发性输卵管卵巢脓肿及其破裂所致的盆腔脓肿，腹膜炎等，多在月经后突然发病，有高热，寒战，头痛，恶心，呕吐，下腹痛，脓性白带增多，双侧附件增厚，压痛。
3.其他部位淋病
(1)淋病性结膜炎：新生儿常在出生后2~3天出现症状，多为双侧，表现为眼睑红肿，有脓性分泌物，成人多为自身感染，常为单侧，表现同新生儿，由于有脓液外溢，俗称“脓漏眼”,一旦延误治疗，可出现角膜穿孔导致失明。
(2)淋球菌性咽炎：表现为急性咽炎或急性扁桃体炎，偶伴发热和颈淋巴结肿大，有咽干不适，咽痛，吞咽痛等症状。
(3)淋球菌性肛门直肠炎：表现为里急后重，有脓血便，肛管黏膜充血，脓性分泌物，淋球菌培养阳性。
4.播散性淋球菌感染 播散性淋球菌感染是由于淋球菌通过血行播散到全身，出现较严重的全身感染，如淋球菌性败血症，关节炎，心内膜炎，脑膜炎等。